Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Npas1P97459 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Npas1P97459 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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