Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms