Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SgcgP82348 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SgcgP82348 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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