Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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