Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NficP70255 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NficP70255 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NficP70255 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NficP70255 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NficP70255 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NficP70255 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NficP70255 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NficP70255 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NficP70255 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NficP70255 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NficP70255 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NficP70255 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NficP70255 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms