Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SbdsP70122 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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