Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UbdP63072 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UbdP63072 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UbdP63072 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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