Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rps3P62908 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rps3P62908 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms