Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra1P62812 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra1P62812 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms