Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Lmo4P61969 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms