Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psme3P61290 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms