Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Abce1P61222 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abce1P61222 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms