Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms