Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Cldn18P56857 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Cldn18P56857 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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