Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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