Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epb41l4aP52963 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms