Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms