Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtgfrP43117 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtgfrP43117 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PtgfrP43117 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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