Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms