Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtlP38585 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtlP38585 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtlP38585 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtlP38585 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtlP38585 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TtlP38585 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TtlP38585 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms