Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa10P31310 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms