Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxraP28700 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxraP28700 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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RxraP28700 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxraP28700 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RxraP28700 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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