Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb1P28230 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms