Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms