Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms