Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms