Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms