Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms