Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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