Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms