Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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CcnkO88874 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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CcnkO88874 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CcnkO88874 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CcnkO88874 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CcnkO88874 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CcnkO88874 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CcnkO88874 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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