Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms