Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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