Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb10O35955 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms