Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sp100O35892 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sp100O35892 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sp100O35892 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sp100O35892 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Sp100O35892 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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