Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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