Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Prrt1O35449 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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