Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ColqO35348 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ColqO35348 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ColqO35348 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ColqO35348 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ColqO35348 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms