Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kpna3O35344 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms