Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Kcnk3O35111 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Kcnk3O35111 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnk3O35111 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms