Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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