Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3415J3QMS8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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