Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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