Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Taf4bG5E8Z2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms