Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
XntrpcF8VQM8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms