Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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