Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ankrd50F7BE84 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ankrd50F7BE84 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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