Protein–RNA interactions for Protein: F6W8I0

Yjefn3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yjefn3F6W8I0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Yjefn3F6W8I0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Yjefn3F6W8I0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Yjefn3F6W8I0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Yjefn3F6W8I0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Yjefn3F6W8I0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Yjefn3F6W8I0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms