Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms