Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms